程岳从书包里掏出一只铅笔和一把三角尺,不紧不慢在这张主成分分析的图谱上面画了两条线。
他一边画一边说道:“这张图的左上角这个数据集,是我做的荧光剂对照,溶液里面只有已定浓度的荧光剂,而最右下角则是荧光剂和环糊精所形成的主客体包络物。”
“理论上讲,这两个的光学差距应该是最大的,加入的氨基酸只要能够把荧光剂置换出来,光学信号就会落入在这两个数据集中间,所以我把这两个数据集相连,得到了一个新的坐标,暂且称它为F1吧,与F1垂直的另外一条线,自然而然就是另外一个坐标,先叫它F2。”
刘启光点点头没说话,一旁的孙玉月听得认真,皱着眉头说:“不对啊,这三个怎么反而比包络物还靠右下呢?”
程岳摆摆手:“这就是我接下来要说的。”
他又掏出一张纸,上面画着二十个氨基酸的结构,他知道这些搞有机的,平常几乎用不到氨基酸,不太会记得他们的结构:“总体来说,疏水性强的氨基酸更容易钻进环糊精的内腔中,置换能力更强,所以所在的溶液光学信号,更类似于荧光剂本身的光学信号,所以数据集也更靠近荧光剂的数据集。”
“而亲水性强的氨基酸,置换能力差,所以光学信号更类似于包络物,所以他们的数据集更靠近包络物的数据集。”
“F1的左边,是疏水性强的氨基酸,而其中,带有共轭结构的氨基酸,例如色氨酸和苯丙氨酸,离F1的垂直距离,相比其他同侧的氨基酸来说,更大一些。”
“而F1的右侧,是亲水性强的氨基酸,如果含有苯环或者多个氨基这样的特殊结构,会离F1远一些,而普通只带一个羟基的氨基酸,则会离F1近一些。”
刘启光听着听着,脸上微微露出一些意外的表情。
他本来认为,能够把这么多个结构如此相似的氨基酸,使用光学手段,而不是常见的液相色谱或者质谱,来区分鉴别出来,已经很厉害了。但是,没想到程岳又能把氨基酸结构和对应数据集的位置解释清楚。
程岳继续讲着。
后世类似的分析方法,主要目的都是能够鉴别区分不同的结构类似物质,因为采集参数众多,非常复杂,通常在矩阵转换中,结构和对应的位置,已经失去了可比性。
这次他能够发现两者之间的关系,也算是意外之喜了。
“我的实验采用的系统,是模仿生物体内的pH,所以定在了pH=7.4,在这个pH的条件下,氨基酸除了亲水和疏水以外,还有带有正电荷的碱性氨基酸,以及带有负电荷的酸性氨基酸。”
“由于荧光剂大部分都是带有负电荷的,所以同样带有负电荷的氨基酸,就会与荧光剂相斥,本身水溶性又好,更难发生置换,所以这两个氨基酸,天冬氨酸和谷氨酸,离包络物的数据集是最近的,并且就在F1这条线上面。”
“而孙学姐刚刚提到的这三个更靠右下的氨基酸,是带有正电荷的氨基酸,”
程岳反手掏出最开始的滴定曲线,“通常,荧光剂形成主客体包络物后通常会发生猝灭,发出的荧光减弱,而随着荧光剂被越来越多加入的氨基酸置换后,荧光应该会增强。”
“但是,当加入正电荷氨基酸的时候,”
程岳又拿出一张核磁共振图谱,上面清楚地标化着每一个氢,“氨基酸会与带有负电荷的荧光剂相吸,反而不会积极地把荧光剂置换出来,所以就会形成了一个‘氨基酸-荧光剂-环糊精’这样一个三体结构。”
“荧光剂的荧光反而更加被抑制了。”
“原来是这样!”
听完他的讲述,首先惊呼出来的居然是听得入迷的崔齐。
其实,当时程岳在帮他写英文论文,是他参与做了这个滴定,还以为自己哪里出错了,怀疑了自己半天。
孙玉月也是不禁说道:“真是厉害!”
刘启光说实话,甚至有一种听得十分过瘾的感觉,他忍不住出声:“看到了吗?你们要多向程岳学习,做实验不是编故事,很多东西张口就来,你的每一个论点,都要像这样,有充足的数据支撑。”
“在你们开组会的时候,不要拿出一个什么结果来就跟我一顿乱讲,问什么都是推测的,如果有这种推测,就要拿出证据来,就像他的滴定曲线,还有核磁共振图谱。”
“不要我问一句才知道没做,还要浪费一周时间。”
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